算。

依据《劳动法》第41条的规定，加班是指用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，安排劳动者在法定工作时间以外工作。对于标准工时制的劳动者来说，凡是在法定工作时间之外的工作都应当算作加班。在这种情况下，双休日出差是否算作加班，关键看劳动者当天是否提供了本职工作范围内的劳动。如果劳动者提供了劳动，根据《劳动法》第44条的规定，用人单位应支付不低于工资200%的工资报酬。如果劳动者并未提供劳动，而是处于休息状态，该双休日不算加班。值得注意的是，出差往返占用双休日的，也应计入加班时间。

至于出差补助，是不能取代加班工资的。出差补助，一般指单位职工因公出差享有的住宿费标准、市内交通费标准、伙食补贴以及因出差而享有的其他补助，其性质是经济补偿。加班工资的性质则是工资报酬。当工作任务需要劳动者在双休日出差完成时，用人单位既要给予补助，也要支付加班工资。

因此，为避免因双休日出差而引发的加班费争议，用人单位对那些需要长期或者频繁出差的工作岗位，可依法向劳动行政管理部门申请不定时工时制。