工程结算单有法律效力。出现工程纠纷时，工程结算单可以作为起诉的证据，此外还其他证据的证明。工程双方有法定权限的代理人在工程结算单上签字，在法律上属于双方对工程结算的确认，委托方要按工程结算单上的结算结果和工程施工合同的约定支付工程款。工程结算单也要双方的盖章，才能更好的保障工程结算单的法律效力。

对工程结算单印章有异议怎么办

施工方对工程结算单的印章有异议可以依法向法院起诉。法律规定，工程结算单在法律上属于双方对工程结算的确认，委托方应该按照工程结算单上所列的结算结果和工程施工合同的约定支付工程款。委托方不按照工程结算单上所列的结算结果和工程施工合同的约定支付工程款的，施工方可以依法向法院起诉。

《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十条当事人约定，发包人收到竣工结算文件后，在约定期限内不予答复，视为认可竣工结算文件的，按照约定处理。承包人请求按照竣工结算文件结算工程价款的，应予支持。