恶意克扣工资的投诉方法如下：

1、向劳动保障部门投诉。公司克扣工资，员工可以向劳动保障行政部门投诉，首先是向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门出面作为中间人，对公司的克扣行为进行调查，假如公司确实是无理由克扣，监察可以责令单位及时支付已克扣的工资；

2、申请劳动仲裁。公司克扣工资，员工也可以向劳动人事争议仲裁委申请仲裁，带上准备的证据材料，以及双方的身份信息材料，及时去提交劳动仲裁申请书；

3、向法院起诉。公司克扣工资，员工也可以向人民法院起诉，提起诉讼的前提条件是已经走了劳动仲裁程序了，因为按照法律的规定，劳动人事争议仲裁是劳动官司的前置条件，只有先走了劳动仲裁程序，才能去人民法院申请强制执行。

法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十条

用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。

用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

第三十一条

用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。

恶意克扣工资怎样办

恶意克扣工资的处理办法有：

1、到劳动行政部门举报；

2、到劳动仲裁委员会申请仲裁；

3、如果对仲裁结果不满意的在拿到仲裁书后15天之内到法院起诉。

工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果是用人单位没有理由故意拖欠员工工资的，属于是违法的。