该公司的员工加班费计算标准根据加班时间不同而有所差异。在平时工资的基础上加班,加班费按照1.5倍的标准计算;休息日加班的,加班费按照员工平时工资的两倍计算;法定节假日加班的,加班费按照员工平时工资的三倍计算。

根据员工在工作日加班的时间不同，加班费的计算标准有所差异。具体规定如下：

一、如果员工在平时工资的基础上加班，那么加班费将按照1.5倍的标准来计算。

二、休息日加班的，加班费按照员工平时工资的两倍计算。

三、法定节假日加班的，加班费按照员工平时工资的三倍计算。

加 班 费 计 算 规 则 ： 平 时 工 资 x 2

根据我国《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当支付职工加班费。其中，加班费的计算规则为：平时工资的300%。因此，若规定职工平时工资为X，则加班费的计算公式为300%X。

然而，有些用人单位在发放加班费时存在违规行为。例如，有的用人单位在发放加班费时，仅按照平时工资的1.5倍计算。这种行为违反了《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，侵犯了职工的合法权益。

根据《劳动合同法》第四十四条的规定，用人单位因生产经营需要，经与工会或者全体职工协商后，可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。

同时，《劳动合同法》第四十九条规定，用人单位因本法第三十九条或者第四十一条规定的情形，不能按照本法规定安排劳动者在休息日或者法定节假日工作的，应当支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。

因此，对于用人单位违规发放的加班费，劳动者有权利要求用人单位按照法定规定支付相应的工资报酬。同时，劳动部门也应当加强对用人单位的监管，严格执行相关法规，保障劳动者的合法权益。

有些用人单位在发放加班费时存在违规行为,违反了《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定,侵犯了职工的合法权益。因此,劳动者有权利要求用人单位按照法定规定支付相应的工资报酬,劳动部门也应当加强对用人单位的监管,严格执行相关法规,保障劳动者的合法权益。

《劳动合同法》第四十四条，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；

（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；

（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。