二手房土地增值税计算方法：

(1)以1%的税率征收。计算公式为应纳税额=成交价的1%

(2)或者减除法定扣除项目金额后，按四级超率累进税率征收。具体方法如下：

计算增值额的扣除项目有：取得土地使用权所支付的金额;开发土地的成本、费用;新建房及配套设施的成本、费用，或者旧房及建筑物的评估价格;与转让房地产有关的税金;财政部规定的其他扣除项目。

一、土地买卖税率

营业税及附加（出让方）：1、按转让价与购置价的差价缴纳5%的营业税。2、按缴纳的营业税缴纳7%的城建税和3%的教育费附加。二、印花税和契税（双方）：1、按产权转移书据（合同）所载金额缴纳0.05%的印花税。2、按成交价格（合同）缴纳3%的契税（有的地方是5%）。三、土地增值税（出让方）：1、按取得收入减除规定扣除项目金额后的增值额，缴纳土地增值税。2、规定扣除项目：取得土地使用权所支付的金额；开发土地的成本、费用；与转让房地产有关的税金等。3、税率的确定四档：增值额未超过扣除项目金额的50%的部分，税率为30%；增值额超过扣除项目金额的50%至100%的，税率为40%；增值额超过扣除项目金额的100%至200%的，税率为50%；增值额超过扣除项目金额200%的，税率为60%。

二、土地增值税征收方式确定

土地增值税按照取得的收入扣除规定的项目后的增值额进行征收。取得土地使用权的价款、开发土地的成本费用、与房地产转让有关的税费等，增值税不超过扣除项目金额百分之五十的，税率为百分之三十；如果增值税超过了扣除项目金额的百分之五十至百分之一百的，税率为百分之四十。