商铺租赁合同丢失的，应该立即采取以下的补救措施：

1、可以要求对方按原合同内容补签一份租赁合同。

2、可以要求对方在原租赁合同的复印件上重新签名或盖上公章。

租赁合同是双方对租赁期间的权利义务的约定，如果租赁合同丢失而不及时采取补救措施的，万一以后双方产生纠纷，就可能对主张自己的权益产生严重的影响，甚至于无法维护自己的权益。

一、商铺租赁合同明确条款

1、必须订立正式的租赁合同所谓正式的租赁合同就是经工商备案认可的租赁合同．你可以到当地工商部门购买。

2、必须要求出租方出示房屋产权证书原件和身份证件。

如系共有产权的需共有人一起签字方可生效。

3、在订立合同时除租金外还必须明确其他各项费用的承担方如房屋租赁税金物业管理费修缮费用等。

4、如所租商铺需经装修后方可使用的需明确装修的范围。

5、如商铺所有权人在租赁期间出售或抵押商铺的须在合同中明确应保证承租人继续租赁的权利否则出租方需赔偿损失。

6、应在合同中明确是否允许承租人转租他人。

7、订立合同时所有权人和共有人需同时到场签字并盖章．不可由他人代替。

二、登记的效力主要包括的内容

1、登记与否不影响合同本身的生效，即使没有办理备案等记，合同依然在生效条件满足时就生效；

2、经登记的案件，具有对抗第三人的法律效力，比如，若出租人将房屋出租给两个承租人的，其中一个合同办理了租赁登记，另一个没有办理租赁登记，则房屋应当租赁给办理租赁登记的承租人，出租人并向没有租赁登记的承租人承担违约责任。

因此，建议及时赴该商铺所在地房地产交易中心办理租赁备案登记。另外，大多数工商部门在办理营业执照时，均要求租赁合同经过租赁备案登记。