轻伤案件已经在派出所调解的，检察院仍可以起诉。

根据《刑事诉讼法》的规定，对于轻伤案件，可以由公安机关组织双方当事人进行和解，达成和解协议并取得被害人谅解的，可以由法院予以从宽处理；

对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，检察院也可以作出不起诉的决定。所以，轻伤案件在公安机关达成和解协议后，检察院根据案件具体情况，仍是可以向法院提起公诉的。

双方达成和解派出所可以撤案吗

经鉴定构成轻伤以上的应当追究刑事责任，涉嫌故意伤害罪，新刑事诉讼法引进了刑事和解程序，因民间纠纷引起的故意伤害致人轻伤案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，积极赔偿被害人取得谅解，被害人自愿和解的，可以从宽处理。犯罪情节轻微的，可以作出不起诉决定。

《刑事诉讼法》第二百九十条规定，对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。

人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民法院可以依法对被告人从宽处罚。