轻伤案件已经在派出所调解的，检察院仍可以起诉。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，对于轻伤案件，可以由公安机关组织双方当事人进行和解，达成和解协议并取得被害人谅解的，可以由法院予以从宽处理于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，检察院也可以作出不起诉的决定。

轻伤二级检察院一定会起诉吗

不一定，如果达到人民检察院不起诉的条件的，可以作出不起诉的决定。

根据刑事诉讼法第175条第4款、第177条第1款的规定，不起诉分为法定不起诉和酌定不起诉两种类型。

（一）法定不起诉。包括两种情况，一是符合刑事诉讼法第16条规定的6种情形之一的，以及犯罪行为不是犯罪嫌疑人实施的，应当做出不起诉决定；二是对于经两次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，也应当做出不起诉的决定。

（二）酌定不起诉。指对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者可以免除刑罚的，人民检察院酌情决定，可以做出不起诉的决定。

《刑事诉讼法》第175条第4款规定，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

第177条第1款规定，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第二百八十八条下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：

（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；

（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。

第二百八十九条双方当事人和解的，公安机关、人民检察院、人民法院应当听取当事人和其他有关人员的意见，对和解的自愿性、合法性进行审查，并主持制作和解协议书。