环保税与排污许可证没有必然的关系。缴纳环保税和有排污许可证无关，废气的排放有实际测量法和系数法，如果达标，可以不缴纳环保税。有下列情形，不属直接向环境排放污染物，不缴纳环境保护税：

1、企业事业单位和其他生产经营者向依法设立的污水集中处理、生活垃圾集中处理场所排放应税污染物的；

2、企业事业单位和其他生产经营者在符合国家和地方环境保护标准的设施、场所贮存或者处置固体废物的。

环保税税率如何计算

1、环保税税率具体适用计算方式：应税大气污染物的税额幅度为每污染当量1．2元至12元，水污染物的税额幅度为每污染当量1．4元至14元，具体适用税额的确定和调整，可由各地人民代表大会常务委员会在法定税额幅度内决定。

2、根据相关法律，应税大气污染物和水污染物的税额由省政府提出，报人民代表大会常务委员会决定。应纳税额＝污染当量数具体适用税额。污染当量数＝污染物的排放量该污染物的污染当量值（污染当量值依照《应税污染物和当量值表》执行）。

《中华人民共和国税收征收管理法》第三条税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。

《中华人民共和国税收征收管理法》第二条凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。