在主合同无效的情况下，补充合同的效力问题，需要区分不同的情况。

1、如果主合同已经实际履行，主合同及补充协议均有效;

2、主合同尚未生效，补充协议内容可独立履行的，补充协议有效;

3、不能独立履行的，效力待定。

一、主合同与补充合同不一致怎么处理

主合同与补充合同不一致处理的标准：

一、以具有合法性和有效性的协议为准。当主合同与补充合同不一致时：

1、应首先考虑冲突条款的合法性和有效性；

2、其中一项冲突条款因违法无效的，以另一项具有法律效力的协议为准；

3、例如，当主合同约定发生争议时，由仲裁机构管辖，补充协议约定由仲裁机构管辖，也可以向法院提起诉讼；

4、此时，补充合同的争议管辖权协议无效，仍以主合同的协议为准；

二、在所有合法性和有效性的情况下，以补充合同约定的冲突处理规则为准。例如，补充合同规定，当主合同和补充合同的条款不一致时，以补充合同为准；

三、在合法有效且补充合同未约定冲突处理规则的情况下，以最终签订的补充合同条款为准。

二、合同附件与合同不一致该怎么办

合同附件与合同不一致的办法：

1、如果主合同与合同附件发生冲突，实践中一般以主合同为准，合同附件只是对主合同的说明；

2、如果没有明确约定，附件一般可以用来解释主合同，附件应服从合同约定；

3、补充协议条款与原合同不一致或者发生冲突的，以补充协议为准，但原合同规定不变的条款，补充协议中规定条款的变更不具有法律效力。

三、合同附件与合同不一致该如何

合同附件与合同不一致的办法：

1、如果主合同与合同附件发生冲突，实践中一般以主合同为准，合同附件只是对主合同的说明；

2、如果没有明确约定，附件一般可以用来解释主合同，附件应服从合同约定；

3、补充协议条款与原合同不一致或者发生冲突的，以补充协议为准，但原合同规定不变的条款，补充协议中规定条款的变更不具有法律效力。