公司合并员工不愿意的，一般情况下是没有赔偿的。公司合并后，原劳动合同继续有效，劳动合同由合并后存续的公司或者新设的公司继续履行。员工因公司合并与公司解除合同不属于需要支付经济补偿金的情形。

一、如何安排公司合并后的员工工作

公司合并后员工与原公司签订的合同继续履行，员工继续留在合并后的公司工作。

如果合并后的公司与员工解除合同，或者因为薪酬、岗位、福利等因素变化员工选择离职的，则合并后的公司需要在解除劳动合同后支付劳动经济补偿金。

经济补偿金按照员工在单位工作每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

二、公司合并债权债务怎样处理？

公司合并债权债务应该按下列方式进行处理：依法应由合并后存续的公司或者新设的公司承继。公司合并分为吸收合并和新设合并，因合并而解散的公司应当办理注销登记，但无需清算。公司合并的，其权利和义务由合并后的公司享有和承担。

三、公司合并员工赔偿标准

公司合并导致合同不能继续履行的，对员工的赔偿以经济补偿为准。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。如果公司合并后，员工可以继续履行合同的，则不需要进行赔偿。