《中华人民共和国土地承包法》2003年3月1日施行，我国大部分地区第二轮承包(亦称二轮延包)已经结束，农业部《中华人民共和国农村土地承包经营权证管理办法》2004年1月1日起正式施行，但由于已经取得的《承包经营权证书》仍为有效，故审判实践中，仍然常常会遇到一方的合法承包经营权与相对方的《承包经营权证书》发生冲突的现象。

一、农村土地经营权证怎样过户

根据《民法典》第三百三十三条规定：土地承包经营权自土地承包经营权合同生效时设立。登记机构应当向土地承包经营权人发放土地承包经营权证、林权证等证书，并登记造册，确认土地承包经营权。

那么农村土地承包经营权证去哪里办理呢？根据不同的经营承包经营方式（以家庭承包经营的承包方、其他方式承包经营的承包方）由县级以上地方政府依法登记、审核、核发。县级以上地方人民政府农业行政主管部门负责农村土地承包经营权证的备案、登记、发放等具体工作。

乡（镇）人民政府农村经营管理部门受理变更申请后，应及时对申请材料进行审核。符合规定的，报请原发证机关办理变更手续，并在农村土地承包经营权证登记簿上记载。

二、土地承包经营权证办理流程是什么

根据我国《农村土地承包经营权证管理办法》的规定，实行家庭承包的，应当按照以下程序颁发农村土地承包经营权证：

第一，土地承包合同生效后，发包方应在30个工作日内，将土地承包方案、承包方以及承包土地的详细情况、土地承包合同等材料一式两份报乡(镇)人民政府农村经营管理部门。

第二，乡(镇)人民政府农村经营管理部门对发包方报送的材料予以初审。材料符合规定的，及时登记造册，由乡(镇)人民政府向县级以上地方人民政府提出颁发农村土地承包经营权证的书面申请;材料不符合规定的，应在15个工作日内补正。

第三，县级以上地方人民政府农政主管部门对乡(镇)人民政府报送的申请材料予以审核。申请材料符合规定的，编制农村土地承包经营权证登记簿，报同级人民政府颁发农村土地承包经营权证;申请材料不符合规定的，书面通知乡(镇)人民政府补正。

第四，乡(镇)人民政府农村经营管理部门领取农村土地承包经营权证后，应在30个工作日内将农村土地承包经营权证发给承包方。发包方不得为承包方保存农村土地承包经营权证。