员工举报公司的，接受举报的部门应当及时进行调查，如果用人单位确实存在违法违规行为的，应当责令其进行改正、给劳动者造成损失的应当赔偿损失等并将调查和处理结果反馈给举报员工。如果查证不属实，也应当将调查结果反馈给举报员工并说明原因。

员工举报公司违法行为是否合法

员工举报公司违法行为是合法的。根据我国劳动法的有关规定，用人单位成立后，应当依法经营生产，依法履行劳动权利义务，不得违法经营，不得随意侵犯劳动者的合法权益；用人单位有违法行为的，劳动者可以向有关机构举报投诉或者向媒体公布，劳动者向媒体曝光用人单位有违法行为；承担举证责任。劳动者曝光的违法行为经核实属实的，劳动监察部门应当对用人单位的具体违法行为给予相应处罚。

《劳动保障监察条例》第十八条

劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，根据调查、检查的结果，作出以下处理：

（一）对依法应当受到行政处罚的，依法作出行政处罚决定；

（二）对应当改正未改正的，依法责令改正或者作出相应的行政处理决定；

（三）对情节轻微且已改正的，撤销立案。

发现违法案件不属于劳动保障监察事项的，应当及时移送有关部门处理；涉嫌犯罪的，应当依法移送司法机关。