发票存根联保存期为五年。开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存五年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。如果报税务机关查验，而税务机关未能查验，需无限期保存。税务机关在发票管理中有权进行检查印制、领购、开具、取得、保管和缴销发票的情况。

发票存根联丢失怎么办

发票丢失，补办方法根据发票的种类不同而不同，下面分别介绍：

（一）普通发票丢失的补办办法：

1．复印存根联，然后盖章；

2．交给客户入账；

3．财务人员应该设置发票登记本，登记购入发票的数量、号码，开出的发票号码、日期、客户、金额、领取人；

4．然后送给客户要客户回签。

（二）增值税发票丢失的补办办法：

1．把存根联复印，

2交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明，

3．报本公司主管税务局，开具红字发票冲原开发票，

4．再重新填开发票给客户。

《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。

《中华人民共和国发票管理办法》第三十三条单位和个人从中国境外取得的与纳税有关的发票或者凭证，税务机关在纳税审查时有疑义的，可以要求其提供境外公证机构或者注册会计师的确认证明，经税务机关审核认可后，方可作为记账核算的凭证。

《中华人民共和国发票管理办法》第三十一条印制、使用发票的单位和个人，必须接受税务机关依法检查，如实反映情况，提供有关资料，不得拒绝、隐瞒。

税务人员进行检查时，应当出示税务检查证。