一、公司应该如何合法安排员工的工作时间

用人单位方法安排劳动者加班，应当遵守以下规定：与工会和劳动者协商，不得强迫劳动者；一般每日不得超过1小时，需要延长工作时间每日不得超过3小时，每月不得超过36小时；依法支付加班费；其他。

二、限制延长工作时间怎么办

限制延长工作时间的具体措施：

1．从准许加班加点人员上限制，禁止安排未成年工，怀孕女工和哺乳未满12个月婴儿的女职工在正常工作日以外加班加点；

2．限制加班加点工资，限制对加班工资的发放，加强管理监督等。

《中华人民共和国劳动法》第四十四条

有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；

（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；

（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

三、加班费的仲裁时效

加班费劳动仲裁时效是一年。具体如下：

1．拖欠工资争议，劳动者申请仲裁时劳动关系仍然存续，仲裁时效从离职之日开始计算，除非能够证明劳动者已经收到拒付工资的书面通知的除外；

2．如果劳动者在离职之后一年内可以要求用人单位支付拖欠的所有加班工资，除非劳动者者已经收到拒付工资的书面通知的除外。

有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

1．安排劳动者延长时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；

2．休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；

3．法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

《中华人民共和国劳动法》（2018修正）：第四章　工作时间和休息休假　　第四十四条　有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：\n（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；\n（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；\n（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。