总分公司，如果均是独立核算的，能互相开票。总公司具有法人资格，而分公司不具有法人资格，但分公司能够以自己的名义从事民事活动，因此独立核算的总分公司能互相开票。

一、总公司和分公司债务如何承担

总公司作为法人，具有企业法人资格，分公司一般不具有法人资格，两者之间债务承担如下：第一、企业法人无力偿还债务时，以其不具法人资格的分支机构财产清偿。分支机构经营管理的财产是企业法人经营管理的财产或者属企业法人所有的财产，对企业法人的债务可以由分支机构负责偿还。第二、不具法人资格的企业法人分支机构的债务，由企业法人负担。1、根据《公司法》规定，公司可以设立分公司，分公司不具有企业法人资格，其民事责任由公司承担。2、根据法律规定，不具有法人资格的企业法人的分支机构，以自己的名义对外签订保证合同，一般应当认定无效。但因此产生的责任，分支机构如有偿付能力的，应当自行承担；如无偿付能力的，由企业法人负担。3、企业法人的分支机构如无代为履行或者代偿能力，在有关保证责任的诉讼中应将该企业法人列为诉讼当事人，并承担保证人应承担的民事责任。

二、分公司可以入股吗

分公司是指一个公司的分支机构，是指公司在其住所以外设立的以自己的名义从事活动的机构。分公司不可以入股。分公司不是企业法人，因此，不具有法人资格，不能独立承担民事责任，不是能持有股权的民事权利主体。没有法人财产权，不是持有股权的适格主体。

三、总公司是分公司的股东吗

不是，分公司是总公司下属的直接从事业务经营活动的分支机构或附属机构。虽然分公司有公司字样，但它不是真正意义上的公司。因为分公司不具有企业法人资格，不具有独立的法律地位，不独立承担民事责任，所以总公司是分公司的股东。