不可以。

不应当扣除因参加了医疗保险已得到赔付的部分，不管参加的医疗保险是什么性质。理由是与保险公司之间是保险合同关系，另一种是侵权纠纷，两种之间的法律关系是不一样的，不能混在一起。在保险公司能否得到赔付与其被侵权能否得到赔偿是不相关的。保险公司不能因为已赔偿了的全部医疗费而拒绝赔付医疗费，同样，侵权人也不能因为的部分医疗费已由保险公司赔付而不再赔偿。

人身保险的被保险人因第三者的行为而发生死亡、伤残或者疾病等保险事故的，保险人向被保险人或者受益人给付保险金后，不得享有向第三者追偿的权利。根据该条的规定，人身保险的被保险人在因第三者的行为而发生死亡、伤残或者疾病后，可以向保险公司要求赔付，经保险公司赔付后，其仍有向第三者要求赔偿的权利。

保险赔偿(报销)与侵权赔偿是两个独立并行的债务。主张保险报销的依据是保险合同，主张侵权赔偿的依据是侵权法律关系，不能因其中一个债务的清偿而消灭另一个。如果在意外伤害医疗保险条款中无关于被保险人由于遭受第三者伤害，依法应由第三者负赔偿责任时，保险人不负给付医疗费责任之约定，保险人应负给付医疗费的责任。因此按照中国人民银行的批复精神，医疗费用可以重复给付。

交通事故纠纷属于侵权纠纷，就侵权人责任的减免只能由法律规定，法律没有规定的情况下，不能随意减免侵权人的侵权责任。

医疗保险报销的数额不应从赔偿数额中扣除，仍可就全部医疗支出及其它损失向侵权责任人主张赔偿。