商品房预售合同若被确认无效，有以下处理方式：假如该预售合同尚未实际履行，则卖方须向买方全额退还所收取的所有房款，而买方亦需将所得房屋交还给卖方。相反，如果预售合同已经得到了实际履行，那么其对合同其余部分的有效性并不产生任何影响，仍被认定为有效合同。对于已被判定无效的合同中所涉及到的经济往来，如收取的款项和交付的房屋等，应按照相关法律法规进行返还或者折价补偿。

此外，还应对因无效行为给对方造成的损失给予适当的赔偿。

《中华人民共和国民法典》第一百五十六条

民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。第一百五十七条民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。