一、员工辞职跳槽,用人单位扣留档案怎么办

1、可以向劳动行政部门举报。《劳动合同法》84条规定，用人单位扣押劳动者证件的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者。

2、为员工办理档案转移手续是公司的法定义务，《劳动合同法》第50条规定：“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在15日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。”《企业职工档案管理工作的规定》第18条也指出：“企业职工调动、辞职、解除劳动合同或被开除、辞退等，应由职工所在单位在一个月内将其档案转交其新的工作单位或其户口所在地的街道劳动(组织人事)部门。”

“职工被劳教、劳改，原所在单位今后还准备录用的，其档案由原所在单位保管。”《关于固定工签订劳动合同有关问题的函》同样表示，用人单位与职工解除劳动关系后，应及时将职工档案转到职工新的接收单位;无接收单位的，应转到职工本人户口所在地。

也就是说，不管劳动者以何种方式离开用人单位，用人单位均应及时将其个人档案转出。即公司无论基于什么原因、出于什么目的扣留你的档案，尤其是在你一再要求之下仍然我行我素，明显是错误的。

二、公司就你的违约行为追究赔偿责任必须通过合法途径解决

虽然《劳动合同法》第90条规定：“劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。”但这并不等于用人单位向劳动者索要损失便能够随心所欲，甚至可以采取以扣压劳动者档案的方式“以毒攻毒”，而是应当区别两者是两个不同的法律概念和义务主体，照样只能通过协商一致、仲裁、诉讼的等正当方式来维权。