1、从保护犯罪嫌疑人正当权利的角度看，犯罪嫌疑人不认罪的案件，检察机关不应作定罪不诉。

2、检察机关的定罪不起诉权本质上是一种程序性权力，检察机关要作出定罪不起诉的处理决定，程序上应当得到犯罪嫌疑人的自认。

3、从刑事诉讼程序的正当性原则出发，检察机关不宜对不认罪的犯罪嫌疑人作出定罪不诉的决定。

一、存疑不起诉有什么后果

存疑不起诉是我国刑事诉讼法规定的三类不起诉情形中的一种，是现代刑法“有利被告”思想和诉讼经济原则的具体体现。其适用的对象是事实不清、证据不足的案件。由于作存疑不起诉处理的案件会涉及到具体的刑法罪名，人们通常将这类案件称之为“疑罪”。存疑不起诉，关键在于如何准确认识和把握疑罪。这是司法实践中分歧较大的问题，也是现实中迫切需要解决的问题。它关系到能否正确贯彻疑罪从无的诉讼原则，关系到办案质量和司法公正。存疑不诉的后果在于检察机关决定“存疑不起诉”，是因为不能确定犯罪嫌疑人构成犯罪和需要追究刑事责任，而对案件侦查终结作出终止或者终结的决定。实质上是人民检察院通过刑事诉讼法赋予的侦查手段，对犯罪嫌疑人进行刑事侦查，无法证明犯罪嫌疑人有犯罪事实而作出的最终确认。存疑不起诉并不是绝对不起诉，如果在之后发现了新的证据，这个时候是可以进行起诉的。

二、醉驾不起诉属于犯罪吗

不起诉属于情节轻微，法律意义上是作为无罪处理，不算追究刑事责任。醉驾标准：车辆驾驶人员血液中的酒精含量大于或者等于80mg/100mL的驾驶行为属于醉驾。醉驾相对不起诉是可以办无犯罪记录的，没有起诉就代表着案件没有进行到起诉的阶段，也没有凶罪的依据，在办理无犯罪证明的时候就需要到当地的派出所进行开具，这样才算是合法的。未经人民法院依法判决，对任何人都不得确认有罪。”因此，检察机关决定不起诉，只能是按“无罪化”或“非罪化”处理的，绝不能认为是作有罪处理。相对不起诉案件对应的犯罪情节轻微中的“犯罪”，一是检察机关对犯罪嫌疑人的行为符合犯罪构成要件的确认，即检察机关经过对案件事实、证据的审查，确定行为符合刑法分则规定的某一罪名的构成要件。二是相对不起诉中的犯罪情节轻微中的“犯罪”，是检察机关在审查起诉阶段的认识，对行为人作出不起诉决定，意味着行为人没有犯罪记录存在。综上，检察机关作出相对不起诉决定，是对行为人作出无罪处理。与此同时，对于行为人需要被行政处罚、行政处分或者没收违法所得的，应当移送主管部门处理。

三、附条件不起诉的六种情形

附条件不起诉是指检察机关对应当负刑事责任的犯罪嫌疑人，认为可以不立即追究刑事责任时，给其设立一定考察期，如其在考察期内积极履行相关社会义务，并完成与被害人及检察机关约定的相关义务，足以证实其悔罪表现的，检察机关将依法作出不起诉决定。