如果用人单位丢失职工的档案，侵害了职工的合法权益，由用人单位担责。用人单位应当确定档案机构或者档案工作人员负责管理本单位的档案，并对所属单位的档案工作实行监督和指导；应当建立科学的管理制度，便于对档案的利用；按照国家有关规定配置适宜档案保存的库房和必要的设施、设备，确保档案的安全。

单位丢失档案怎么办？

《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（二）》第五条规定，劳动者请求用人单位办理人事档案移转手续产生的争议，经劳动争议仲裁委员会仲裁后，当事人依法起诉的，人民法院应予受理。《最高人民法院关于人事档案被原单位丢失后当事人起诉原用人单位补办人事档案并赔偿经济损失是否受理的复函》中也指出，保存档案的企事业单位，丢失他人档案的，应当承担相应的民事责任。档案关系人起诉请求补办档案、赔偿损失的，人民法院应当作为民事案件受理。

因此单位如果把劳动者的档案丢失了，劳动者可以申请劳动仲裁并向法院提起民事诉讼，责令公司补办。

《中华人民共和国档案法》第九条

机关、团体、企业事业单位和其他组织应当确定档案机构或者档案工作人员负责管理本单位的档案，并对所属单位的档案工作实行监督和指导。

中央国家机关根据档案管理需要，在职责范围内指导本系统的档案业务工作。