甲状腺认定为工伤的程序：

1、到当地有职业病诊断资格的单位进行职业病诊断，由他们做出职业病诊断证明。

2、再根据诊断证明到当地劳动保障部门申请工伤认定。

3、作出工伤认定决定后，可以申请残疾等级鉴定。

甲状腺癌能申请残疾证吗

残疾人证办理程序：

1、户口所在地的县、市、区级残联领取《残疾人证申请表》和《残疾评定表》；

2、身份证或户口本复印件一张；

3、两寸彩色相片2－6张（多带不碍事，各地标准不一）；

4、残疾类型等级证明：残疾很明显的可以直接到残联进行等级审核办理，不明显的必须到指定医院、指定医生进行评级。目前政策针对肢体、视力、精神、智力四类，一、二级的重度残疾人提供生活补助金，每人每月在50左右（各地经济不同，标准也不一样）。

一切手续完备，就到县、市、区级当地残联进行办理，快的话立等可取，慢的话十天、半个月也差不多了。

补助政策请登陆各自省市残联网站政策法规栏目进行了解。

因此：甲状腺癌一般是不能够申请残疾证的。

《工伤认定办法》第四条

职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。

按照前款规定应当向省级社会保险行政部门提出工伤认定申请的，根据属地原则应当向用人单位所在地设区的市级社会保险行政部门提出。