甲状腺认定为工伤的程序：

1、到当地有职业病诊断资格的单位进行职业病诊断，由他们做出职业病诊断证明。

2、再根据诊断证明到当地劳动保障部门申请工伤认定。

3、作出工伤认定决定后，可以申请残疾等级鉴定。

一、发生工伤事故后应该如何处理？

事故发生后30日内由用人单位申请进行工伤认定，用人单位未按期申请的，伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。

工伤申请需要的材料为：（1）工伤认定申请表；（2）与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；（3）医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

二、如何报工伤的

1.首先用人单位应该在一个月内向劳动局提出工伤认定申请。2.如果单位不申请的话，自己写份工伤认定申请，向当地劳动局申请工伤认定。提交的资料包括：工伤认定申请表;与用人单位存在劳动关系(包括事实劳动关系)的证明材料;医疗诊断证明或者职业病诊断证明书。3.劳动局做出工伤认定决定4.伤者去有资质的医院做伤残鉴定(骨折的话最低也是10级伤残)把医院的伤残鉴定交给劳动局和用人单位(最好自己复印一份保存)，劳动局会发“工伤认定通知书”给用人单位。5.单位开始赔偿，主要包括伤残补助金、医疗费。