企业对合同验收与证据保存怎么保存的，需要根据企业实际的情况进行分析。

1、合同中的验收条款要谨慎制定

订作人、发包人应当及时进行验收。此类合同中，验收是成果接受方的一项权利，也是一项义务。如果成果接受方在合同约定的期限内或合理的期限内没有进行验收，视为其怠于行使自己的权利。

双方当事人在合同中对于验收方式有约定的，从其约定。

2、举证责任的分担

成果接受方在验收期限内应当进行验收，同时应当对验收不合格或验收期间内提出过质量异议承担举证责任。如果公司未能提出证据证明验收不合格，也不能证明其在合同约定的验收期内提出过质量异议，辩称将不被法院采信。

3、提高证据意识

在经济往来中，当事人之间经常使用口头、电话等方式进行沟通，法律意识比较淡漠。一旦合同履行中出现问题涉及诉讼，举证就成为了困难。因此在合同履行过程中，应当培养证据意识，如公司提出质量异议可以采用传真、邮寄、电话录音等方式，使该证据更容易保存下来，因为机会总是留给有准备的人。