用于出资的集体土地使用权是集体经营性建设用地使用权的话，签订的入股协议是有效的，否则可能会因为违反法律的强制性规定而无效。

集体土地使用权原则上是不可以出资的，但是2019年8月26日，土地管理法进行了修订，新的土地管理法第六十三条规定，通过出让等方式取得的集体经营性建设用地使用权可以出资，法律、行政法规另有规定或者土地所有权人、土地使用权人签订的书面合同另有约定的除外。

一、农村土地使用权转让政策

农村土地使用权转让是指拥有土地承包经营权的农户将土地经营权（使用权）转让给其他农户或经济组织，即保留承包权，转让使用权。包括1.农户承包土地经营权，农户承包土地经营权：是指以家庭承包方式承包的耕地、草地、养殖水面等经营权，可以采取出租、入股等方式流转交易，流转期限由流转双方在法律规定范围内协商确定。2.林权，是指集体林地经营权和林木所有权、使用权，可以采取出租、转让、入股、作价出资或合作等方式流转交易，流转期限不能超过法定期限。3.四荒”使用权，四荒”使用权。是指农村集体所有的荒山、荒沟、荒丘、荒滩使用权。采取家庭承包方式取得的，按照农户承包土地经营权有关规定进行流转交易。以其他方式承包的，其承包经营权可以采取转让、出租、入股、抵押等方式进行流转交易。4.农村集体经营性资产，农村集体经营性资产。是指由农村集体统一经营管理的经营性资产(不含土地)的所有权或使用权，可以采取承包、租赁、出让、入股、合资、合作等方式流转交易。5.农业生产设施设备，农业生产设施设备。是指农户、农民合作组织、农村集体和涉农企业等拥有的农业生产设施设备，可以采取转让、租赁、拍卖等方式流转交易。6.小型水利设施使用权，小型水利设施使用权。是指农户、农民合作组织、农村集体和涉农企业等拥有的小型水利设施使用权，可以采取承包、租赁、转让、抵押、股份合作等方式流转交易。7.农业类知识产权，农业类知识产权。是指涉农专利、商标、版权、新品种、新技术等，可以采取转让、出租、股份合作等方式流转交易。8.其他，农村建设项目招标、产业项目招商和转让等。

二、农村集体土地上可以建厂房吗

占用农村建设用地进行建设需要经过相应的审批手续，根据《土地管理法》第四十三条、第五十九条、第六十条、第六十三条，任何单位或个人进行建设，需要使用土地的，如果不符合规定的集体土地使用权主体资格，则必须依法申请使用国有土地。且集体建设用地仅限于兴办乡镇企业、村民建设住宅、乡镇村公共设施和公益事业建设等三种使用范围。若不符合上述规定的集体土地使用权主体资格，既不能在集体土地初级市场取得集体土地使用权，也不能在集体土地二级市场以转让、出让或出租形式获得。综上，农村集体土地上建厂房必须是用于兴办乡镇企业、村民建设住宅、乡镇村公共设施和公益事业建设这三种范围，如果租赁集体土地用以建厂，也仅限于开办与集体经济组织开办的或以入股、联营形式与他人共同举办的乡镇企业。