反垄断执法机构是市场经济国家市场竞争秩序的维护者。因为市场经济国家配置社会资源的根本手段和基本方式是市场竞争，市场竞争秩序是市场经济国家基本的经济秩序，反垄断执法机构便在市场经济国家有着很大的独立性和很高的地位。

反垄断执法机构的独立性反垄断执法机构的独立性是指它能够独立地执行国家的反垄断法和竞争政策，即在执行过程中不必受其他政府部门的干扰。反垄断法执法机构必须有其独立性，这是由反垄断法的特殊任务决定的。反垄断法与一般民商法不同，与反不正当竞争法也不同，其任务是禁止各种严重限制竞争的垄断协议、禁止滥用市场支配地位和控制过大规模的企业合并。反垄断执法机关所干预的限制竞争行为的影响面一般都很大，往往涉及整个市场或者整个行业。如滥用市场支配地位的行为，一般都涉及大公用企业或者大跨国公司。如果反垄断执法机关不具有独立性和权威性，某些政府部门的意见就会左右这个机构的裁决，反垄断法就不可能得到认真的执行，反垄断法也会成为一纸空文。此外，根据国情，我国反垄断法也应当同政府部门滥用行政权力限制竞争的行为作斗争。

因为这些限制竞争行为涉及行政权力，且其背后有着各种各样的经济动机，如保护某些地方企业的利益或者保护某些国有企业的利益，盘根错节，关系复杂，调查难度很大。在这种情况下，如果反垄断法执法机关没有相当大的独立性和权威性，它的审案工作更容易受到与案件相关的某些行政部门的干扰和影响。正是出于反垄断执法机关应当具备高度独立性的考虑，世界银行在其2002年的一个报告中建议，反垄断执法机关的主席最好由国家议会来任命，有自己独立的财政预算。根据报告中对50个发达国家的调研资料，现在63%的国家有独立的反垄断执法机构，即该机构不属于任何政府部门。

有些反垄断执法机构附属于政府部门，如德国联邦卡特尔局在编制上属于德国经济部。然而，联邦卡特尔局的业务则完全独立于经济部，即经济部长无权干预联邦卡特尔对案件的审理和裁决。根据2005第7次修订后的《反对限制竞争法》第42条，联邦经济部长的权限仅是在例外情况下，出于整体经济和社会公共利益的考虑，对某些限制竞争的企业合并给予特殊批准。然而，因为联邦经济部长的这一权力是《反对限制竞争法》授予的，这个法律只是出于不同政策的考虑，授予经济部长这一特殊的权力，所以不应当把经济部长视为一个高于联邦卡特尔局的机构。事实上，尽管德国联邦经济部长有豁免严重限制竞争的企业合并，《反对限制竞争法》第7次修订前还有豁免某些严重限制竞争的卡特尔的权力，但经济部长很少使用这个权力。1989年，联邦经济部长豪斯曼附加条件地批准了戴姆勒—本茨和MBB公司之间的合并。由于这个合并的规模过大，这个批准不仅受到法律界和经济界人士的严厉批评，而且还导致联邦经济部长豪斯曼的下台。国务院提交全国人大的反垄断法草案没有明确行政执法机关。

因为与2005年7月的草案相比，这个草案在执法机关的前面取消了主管二字，这说明我国反垄断执法将来仍可能维持国家工商局、商务部和国家发展改革委员会分割执法的格局。三家机构分割执行反垄断法不是不可能的事情。然而，这种格局很难使我国反垄断执法机构真正成为一个独立机构，即独立地执行国家的竞争政策。例如，附属于国家改革发展委员会的机构便很难执行国家的竞争政策，因为它的主管部门—国家改革发展委员会不是一个专门维护市场竞争秩序的机构，它的主要任务是制定国家的宏观经济政策，在更大程度上考虑的是国家的产业政策，而不是竞争政策。这里，我想到了国家计委和国家经贸委在1998年联合发布的《关于制止低价倾销工业品的不正当价格行为的规定》，据此，国家有关行业部门可研究提出有关具体品种的行业平均成本，经国家计委同意后，定期向社会发布，生产企业的工业品出厂价格原则上不应低于行业本均成本，这即是所谓的行业价格自律。

显然，行业自律价的基础是行业的平均成本，这个成本肯定高于某些经济效益较好企业的个别成本，从而会限制了这些企业的降价幅度。因此，行业价格自律是一种严重限制竞争的行为，其结果是保护落后，损害用户和消费者的利益。然而，值得深思之处是，国家计委一方面执行《价格法》，该法第14条规定，经营者不得相互串通，操纵市场价格，损害其他经营者或者消费者的合法权益;另一方面又要求生产企业按照行业平均成本定价，这是一种自相矛盾的行为。这种现象说明，如果按照现有的格局建立反垄断执法机构，这些机构很难独立地执行反垄断法和国家的竞争政策。反垄断执法机关的独立性除了表现在它与其他政府部门的关系方面，即它能够独立地执行竞争政策和反垄断法，另一方面还表现在它与企业的关系上。因为这个机构的任务是推动市场竞争，反对限制竞争行为，它的工作人员就不能够和被这个机构监督和管制的企业之间存在着经济利益关系。德国《反对限制竞争法》在这个方面作了非常明确的规定，严格禁止垄断委员会的成员和联邦卡特尔的成员与企业发生关系。该法第51条第5款规定，联邦卡特尔局的成员既不得是企业所有人或者领导人，也不得是企业、卡特尔、经济联合会或企业联合会的董事会或监事会的成员。