公司被员工申请劳动仲裁只是解决劳动纠纷的一种法定方式，被申请，申请都是法定的权利与程序义务。被申请了也不会影响公司的证信力，并不能说明公司就有违法与不良行为，不会因此纳入黑名单或受到什么处理。最多是上级主管机关因为劳动纠纷过多，提示公司加强管理和公司的约束机制建设，构建和谐的劳资关系。

一、小股东权益救济的法律基础

小股东权益救济的具体法律机制有：1、危害行为的停止请求权在股份制公司，控制股东可以通过控制董事会来控制公司。而董事的行为对公司有引起不能恢复的损害的可能性。仅董事个人承担责任并不能完全弥补，还必须对这些行为加以事前控制。2、反对股东的股份收买请求权制度反对股东的股份收买请求权是指对于股东利益有重大关系的特定事项，在股东会的多数决议成立的情况下，持反对意见的股东可以请求公司以公平合理的价格收买自己所持有的股份，在公司拒绝回购时，法院可以根据股东的申请，强制公司收购该股东的股份。3、对有瑕疵股东会决议的诉讼制度股东会是公司的权力机构，可就公司的重大事项做出决议，股东应当按照法定的召集程序召开股东会，并依法定的表决方法通过决议。4、股东申请法院质疑公司是否存在之权利当控制股东滥用其控制力，对其他小股东进行压榨或者不公平对待时，并且严重损害了公司或者小股东的权益。5、股东派生诉讼制度当公司利益受到控制股东，母公司，董事监事，管理人员等行为人的侵害行为直接侵害危害到公司利益并最终使小股东的权益受到损害时，由于这些人对公司意志的形成具有很大的影响力，把持公司机关多数股东即为公司利益侵害行为人。

二、工资发重复可以不退是违法吗

工资发重复可以不退是违法的。

1、这种情况属于不当得利；

2、离职后工资多发不退还，如果金额较小，通常用人单位不会予以追究，如果金额较大，用人单位可以到当地人民法院提起民事诉讼，要求劳动者支付不得当利；

3、劳动者和用人单位存在劳动纠纷，可以到用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，维护合法权益。

劳动法规定，劳动者为用人单位付出劳动后，就相应地有获得劳动报酬的权利。这是劳动法赋予劳动者的基本权利之一。因此，劳动者为公司工作了，公司就必须为劳动者支付工资，如果不支付工资，是违法的。而即使是自动离职，但毕竟劳动者是为公司工作过，同样需支付劳动者工资。公司可因你的自动离职作适度的工资扣减，但这必须建立在合乎程序的规章制度度之下，比如规章制度经民主程序讨论经大部分职工认可，进行公示，员工入职有进行培训并签名确认等，或者劳动合同中有约定。否则公司就不能随便扣减员工工资，因为公司没有行政处罚权。而至于扣减工资，一般不能超过20%，或扣减后所剩工资不得低于最低工资标准。

三、仲裁期间公司不能申请破产

仲裁期间公司不能申请破产的说法是错误的。申请破产并不会影响仲裁程序的进程。如果公司满足申请破产的条件，就可以向人民法院提出破产申请，公司是否被仲裁还是被诉讼，都是没有任何影响的，但是很多情况下公司在进行清偿的时候，都不能够偿还全部的债务。公司申请破产的条件：1、公司不能清偿到期债务；2、公司资不抵债或者明显缺乏清偿债务的能力。