一宅两户宅基地确权发证的办法为：如果农民的一户多宅是基于转让、赠予的，即使是一户多宅也是要允许土地确权的。这是农民的合法权益。如果是农民非法占用村集体土地，擅自随意建造房屋，而形成一户多宅，对于非法占有的，要全部没收。

一户主能确权两房吗

一户主两房有时也是可以确权的。户主的两房是通过继承房产、房产赠与、户籍衔接、购买房屋等正规途径获得的话，那么户主的两房就是符合相关的法律规定的，这时就可以进行确权。若不合法的话，就可以通过申请分户的方式来进行确权。

《中华人民共和国土地管理法》第六十二条农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。农村村民住宅用地，经乡（镇）人民政府审核，由县级人民政府批准中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。农村村民出卖、出租住房后，再申请宅基地的，不予批准。