双方因感情不和分居满两年的不能算自动离婚的。我国没有关于自动离婚的规定，且不承认自动离婚的效力，当事人主张解除婚姻关系的，必须依法向婚姻登记机关申请离婚登记，或向法院起诉离婚，法院应当进行调解。如果因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。

怎么理解因感情不和分居两年的标准

认定标准如下：

1．感情不和。因感情不和，双方分开居住，且互不履行夫妻之间的义务。虽然不在一起住了，但不是因为感情不和原因，而是因为其他原因的不算。

2．时间计算上，从提出离婚的夫妻二人共同认可的最后一次同居的第二天起计算，到提出离婚诉讼的当天止。如果分居后又同居，应从同居后又分居的时间重新计算，前面的分居时间终止。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。