医疗期之内的应当发放病假工资，缴纳保险。超过医疗期仍不能上班的，公司可以单方解除合同。协商不成，可以申请劳动仲裁。《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》 第三条企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期： (一)实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上的为六个月。 (二)实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月；五年以上十年以下的为九个月；十年以上十五年以下的为十二个月；十五年以上二十年以下的为十八个月；二十年以上的为二十四个月。 第五条企业职工在医疗期内，其病假工资、疾病救济费和医疗待遇按照有关规定执行。
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《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》对于6个月以内的病假待遇和6个月以上的长病假待遇分别作了规定，但并未将其明确限定为“医疗期内”，因此，对于医疗期满后是否应当按照病假标准支付工资，实务中存在争议。一种观点认为，医疗期满后只要没有解除劳动关系的，应给予相应的病假待遇。而另一种观点认为，对于医疗期满后是否必须支付没有明确规定，因此存在协商确定的余地，即如果企业和员工对按照事假处理达成一致，员工没有异议的，应当予以支持。从近几年的司法实务来看，只要用人单位与劳动者之间的约定不违反法律法规的强制性规定，通常还是认为有效的。
劳动者病情较为严重，在法定医疗期内尚无法治愈的，可以继续请病假。用人单位不能因劳动者在医疗期满后请病假不来上班，就认定劳动者旷工并解除劳动合同。否则，很可能被认定为违法解除。对于这个问题，不同地区有不同观点。单就深圳地区而言，医疗期满后继续请病假的，劳动者不能要求用人单位继续支付工资。因为，《深圳市员工工资支付条例》很明确规定，只有在国家规定的医疗期内，请病假的员工才可以要求支付病假工资。
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