交通事故赔偿纠纷由以下两个部门来调解：1、公安机关的调解：在诉讼前，一般由公安机关交通管理部门对损害赔偿进行调解；2、法院的调解：在民事诉讼中，如果双方在公安机关交通管理部门未达成调解协议或事后反悔的，在审理期间，法院仍可就民事赔偿继调解。

一、交通事故调解协议书签字后有异议的如何处理

根据《道路交通安全法》第七十四条规定：“对交通事故损害赔偿的争议，当事人可以请求公安机关交通管理部门调解，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。经公安机关交通管理部门调解，当事人未达成协议或者调解书生效后不履行的，当事人可以向人民法院提起民事诉讼。”可见，由公安交管部门调解赔偿，不是解决交通事故损害赔偿争议的必经程序，也不是诉讼的前置程序。调解协议不具有法律上的强制力，靠双方自觉履行，其中任何一方不履行或不完全履行，各方当事人均可向人民法院提起诉讼。

同时，根据《民事诉讼法》第二百零七条和最高人民法院《关于适用若干问题的意见》第二百五十四条、第二百五十六条的规定，可以申请法院强制执行的法律文书包括：发生法律效力的判决、裁定、调解书、支付令以及仲裁裁决书、公证债权文书。而其中的调解书是指由人民法院制作的生效调解书，而不包括公安交管部门的调解书。鉴于上述规定，若对方反悔起诉至人民法院，你可以将交通事故调解书作为证据提交给人民法院，由人民法院依法审理。

交通事故调解协议书签字后有异议的如何处理：

1、经交警调解达成了交通事故赔偿协议，具有民事合同的性质，系当事人的真实意思表示，且不违反法律的强制性规定，为有效合同。被告未按协议约定期限和赔偿数额向原告履行赔偿义务，系违约行为，应承担违约责任。

2、协议达成之后，被告反悔，原告可以违约之诉起诉；

3、原告在协议之外要求被告赔偿残疾赔偿金、鉴定费、被抚养人生活费、精神损害抚慰金等请求，因该部分请求已超出协议约定赔偿范围，法院一般不予支持。

二、交通事故处理期限为多久

1、根据《道路交通安全法》第七十四规定：对交通事故损害赔偿的争议，当事人可以请求公安机关交通管理部门调解，也可以向人民法院直接提起民事诉讼。经公安机关交通管理部门调解，当事人未达成协议或调解书生效后不履行的，当事人可以向人民法院提起民事诉讼。2、根据《道路交通安全法实施条例》第九十四条规定：当事人对交通事故损害赔偿有争议，各方当事人一致请求公安机关交通管理部门调解，应当在收到交通事故认定书之日起10日内提出书面调解申请。交通事故致死的，调解从办理丧葬事宜结束之日起开始;对交通事故致伤的，调解从治疗终结或定残之日起开始;对交通事故造成财产损失的，调解从确定损失之日起开始。3、根据《道路交通安全法实施条例》第九十五条规定：公安机关交通管理部门调解交通事故损害赔偿争议的期限为10日。调解达成协议的，公安机关交通管理部门应当制作调解书送交各方当事人，调解书经各方当事人共同签字后生效;调解未达成协议的，公安机关交通管理部门应当制作调解终结书送交各方当事人。

三、交通事故调解保险公司一般需要来吗

调解是指双方或多方当事人就争议的实体权利、义务，在人民法院、人民调解委员会及有关组织主持下，自愿进行协商，通过教育疏导，促成各方达成协议、解决纠纷的办法。根据交通事故处理程序规定的相关规定，涉及交通事故调解的，当事各方当事人或代理人均必须在场，除非某方当事人在调解之前已经委托代理人，由代理人代表到场处理。如任何一方无故不到场的，交警则不予调解或者由交警另行约时间进行。若当事人不在场原则上不能调解，但是如果双方当事人通过电话方式谈好的，事先约定好的，直接签署调解协议的可以例外。公安机关交通管理部门受理了当事人的调解申请后，应当按照法定程序对交通事故进行调解。第一、应当与当事人约定调解的时间、地点，并于调解时间3日前通知当事人。第二、通知有关人员进行调解。通知一般采用书面形式，采用口头形式的要计入调解笔录。第三、必须在法定的期限内进行调解。公安机关交通管理部门调解交通事故损害赔偿争议的期限为10日。