公司进行清算的时候，职工的工资、赔偿金等是比较优先的债务，如果支付完破产费用后，还有财产的就需要支付员工赔偿费用。

公司清算分为两种，一种为正常清算也称公司清算，是指公司除因合并、分立或破产的原因解散外，公司被其他一切原因解散而适用的清算程序。一种是破产清算，是指公司资不抵债时依照《企业破产法》被依法宣告破产时适用的清算程序。

正常清算中，根据《公司法》第一百八十七条的规定：公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。也就是说职工的工资和社会保险费用排在清算费用之后。这时公司不存在资不抵债的情形，公司有能力支付员工的相关补偿。

一、企业清算的程序怎么走

1、公司解散后，成立清算组。自行清算中由公司自行成立清算组；指定清算中由人民法院依相关利害关系人申请指定成立清算组。清算组成立后接管公司，清理公司资产、偿还债务，公司以其资产偿还所有债务后尚有剩余财产的，有限责任公司出资者按照出资比例、股份有限公司按照股东持有股份比例分配剩余财产后，公司进行注销登记，而后公司法人人格消灭。

2、公司的清算，是指在公司解散以后，为了了结公司作为当事人的各种法律关系，使公司的法人资格归于消灭，而对公司未了结的业务、财产及债权债务关系等进行清理、处分的行为和程序。

3、由于公司的破产清算由《破产法》单独调整，本文仅讨论公司的非破产清算公司，因此本文所指的公司清算仅指非破产清算。非破产清算一般是在公司资产可以清偿全部债务的情况下进行的清算。非破产清算包括自行清算和指定清算两类。

二、企业清算的税务怎么处理

1、清算期间资产盘盈、盘亏的税务处理

清算期间资产盘盈、盘亏应当计入清算所得。清算期间不能收回的应收款项应作为坏账损失处理。根据《关于加强企业所得税管理的意见》（国税发［2008］88号）规定，财产损失必须报经主管税务机关审批，未经审批的财产损失不得在计算清算所得时扣除；

2、关于应付未付款项是否并入所得征税问题

企业清算前已确定不需支付的应付款项，应并入生产经营所得征税。企业清算期间确定的不需支付的应付款项，需并入清算所得征税。企业清算期间应支付但由于清算财产不足以偿还的未付款项，无需并入清算所得征税。盈余公积和资本公积属于股东权益，不计入清算所得。