核查重点

1、纳税人变更税务登记，在股东发生变化时，主管税务机关是否及时掌握股权转让合同或协议等相关信息。

2、发生股权转让的纳税人在办理企业所得税年度申报时未按规定填写涉及股权转让相关的附表，主管税务机关汇算清缴时是否按规定进行审核。

3、纳税人重组采取特殊性税务处理，未按规定向主管税务机关备案，主管税务机关是否按一般税务处理进行调整。

4、主管税务机关是否对未满足特殊性税务处理条件的纳税人，及时按一般税务处理进行调整。

5、满足特殊性税务处理条件的企业重组业务，其非股权支付确认的收益是否按规定征收企业所得税；是否按规定确认计税基础；是否按规定亏损弥补和享受税收优惠。

6、是否建立股权转让企业所得税管理台账，对股权转让实施链条式动态管理。

7、对非居民企业股权转让，是否按规定征收预提所得税并按规定进行管理。

8、选择特殊重组后按规定采取申请确认方式的，股权转让方和受让方是异地的，各自主管税务机关之间是否建立信息沟通和传递机制。

一、股权转让所得企业所得税申报方法

1、企业在一般的股权（包括转让股票或股份）买卖中，应该按《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发（2000）118号，废止）有关规定执行。股权转让人应当分享的被投资方累计未分配利润或累计盈余公积金应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得；

2、企业进行清算或者转让全资子公司以及持股95％以上的企业时，应当按《国家税务总局关于印发＜企业改组改制中若干所得税业务问题的暂行规定＞的通知》（国税发（1998）97号，废止）的有关规定执行。投资方应分享的被投资方累计未分配利润和累计盈余公积应确认为投资方股息性质的所得。为避免对税后利润重复征税，影响企业改组活动，在计算投资方的股权转让所得时，允许从转让收入中减除上述股息性质的所得；

3、按照《国家税务总局关于执行＜企业会计制度＞需要明确的有关所得税问题的通知》（国税发（2003）45号）第三条规定，企业已提取减值、跌价或者坏帐准备的资产，如果有关准备在申报纳税时已调增应纳税所得，转让处置有关资产而冲销的相关准备应当允许作相反的纳税调整。因此，企业清算或者转让子公司（或独立核算的分公司）的全部股权时，被清算或被转让企业应按过去已冲销并调增应纳税所得的坏帐准备等各项资产减值准备的数额，相应调减应纳税所得，增加未分配利润，转让人（或投资方）按享有的权益份额确认为股息性质的所得。

二、企业股权投资转让所得和损失的所得税处理

1、企业股权投资转让所得或者损失是指企业因收回、转让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税；

2、企业因收回、转让或清算处置股权投资而发生的股权投资损失，可在税前扣除，但每一纳税年度扣除的股权投资损失，不得超过当年实现的股权投资收益和投资转让所得的，超过的部分可无限期向以后纳税年度结转扣除。