工程承包合同中，常见的问题主要有：

1.因缺少必要的法律常识，合同签订后才发现合同中缺少一些必不可少的法律条款;合同虽已签字但不具备法律效力，使得因履行合同造成损失或发生经济纠纷后承包人得不到法律的保护。

2.在合同执行过程中发现原订合同有些条款因考虑不周，含糊不清，难以分清双方的责任和权利，合同的条款之间、不同的合同文件之间的规定和要求相互矛盾或不相一致。

3.合同双方对同一合同的有关条款理解各异，而合同中未能做具体解释，使得合同双方在合同履行过程中因意见不一致而产生矛盾或争议，以致合同无法正常履行。

4.合同条款漏洞太多，对许多可能发生的情况未作充分估计，因而亦未能相应研究考虑一些补救的条款在合同中做出具体规定。

5.合同一方在合同实施中才发现合同的某些条款对自己极为不利，隐藏着极大的风险，或过于苛刻，使工程合同无法履行。