申请执行期限超过两年是否还能执行需根据具体情况而定。

申请执行人超过申请执行时效期间向人民法院申请强制执行的，人民法院应予受理。被执行人对申请执行时效期间提出异议，人民法院经审查异议成立的，裁定不予执行。被申请人提出证据证明仲裁裁决有下列情形之一的，经人民法院组成合议庭审查核实，裁定不予执行：

1、当事人在合同中没有订立仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁裁决的；

2、裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁机构无权仲裁的；

3、仲裁庭的组成或者仲裁的程序违反法定程序的；

4、认定事实的主要证据不足；

5、适用法律确有错误的；

6、仲裁员在仲裁该案时有贪污受贿，徇私舞弊，枉法裁决行为的。

仲裁裁决被人民法院裁定不予执行的，当事人可以根据双方达成的书面仲裁协议重新申请仲裁，也可以向人民法院起诉。

调解书申请执行期限

调解书申请执行期限是两年。申请进行强制执行的时效是不超过两年，适用于诉讼时效已经中断或者是中止的规定，申请人在提出强制执行的申请之后的六个月之内法院应该采取强制的执行，否则申请人可以向上级法院申请进行执行。上一级人民法院经审查之后可以责令人民法院在一定的期限内进行执行。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十六条申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。

前款规定的期间，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从最后一期履行期限届满之日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。

《最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》的解释》第四百八十三条申请执行人超过申请执行时效期间向人民法院申请强制执行的，人民法院应予受理。被执行人对申请执行时效期间提出异议，人民法院经审查异议成立的，裁定不予执行。

被执行人履行全部或者部分义务后，又以不知道申请执行时效期间届满为由请求执行回转的，人民法院不予支持。