申请执行期限超过两年是否还能执行需根据具体情况而定。

申请执行人超过申请执行时效期间向人民法院申请强制执行的，人民法院应予受理。被执行人对申请执行时效期间提出异议，人民法院经审查异议成立的，裁定不予执行。被申请人提出证据证明仲裁裁决有下列情形之一的，经人民法院组成合议庭审查核实，裁定不予执行：

1、当事人在合同中没有订立仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁裁决的；

2、裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁机构无权仲裁的；

3、仲裁庭的组成或者仲裁的程序违反法定程序的；

4、认定事实的主要证据不足；

5、适用法律确有错误的；

6、仲裁员在仲裁该案时有贪污受贿，徇私舞弊，枉法裁决行为的。

仲裁裁决被人民法院裁定不予执行的，当事人可以根据双方达成的书面仲裁协议重新申请仲裁，也可以向人民法院起诉。

一、申请撤销仲裁裁决案件的裁定撤销问题

关于申请撤销国内仲裁裁决案件的裁定撤销问题。根据仲裁法的规定，人民法院对当事人提出的撤销国内仲裁裁决的申请和相关证据，经组成合议庭审查核实，认定有下列情形之一的，应裁定撤销裁决：

(1)没有仲裁协议。

(2)裁决的事项不属于仲裁协议的范围或仲裁委员会无权仲裁。值得注意的是，按最高法院有关司法解释，如果我国仲裁机构裁决事项超越当事人仲裁协议约定的范围，或不属于当事人申请仲裁的事项，并且上述事项与仲裁机构作出裁决的其他事项是可分的，法院可以基于当事人的申请，在查清事实后裁定撤销该部分。

(3)仲裁庭的组成或者仲裁的程序违反法定程序。实践中仲裁程序违反法定程序的主要表现形式为：仲裁员依法应当回避而没有回避的，仲裁机构没有将仲裁庭的组成情况、开庭时间、地点等事项书面通知当事人的；仲裁庭开庭时当事人未能陈述、进行辩论的；裁决所依据的证据未经另一方当事人质证等情形。

(4)裁决所依据的证据是伪造的。

(5)对方当事人隐瞒了足以影响公正裁决的证据。这里的所谓“足以影响公正裁决的证据”，是指直接关系到仲裁裁决的最后结论有失公正的证据。其通常与仲裁案件所涉及的纷争焦点或重要情节有着直接的关系，同时也直接影响着仲裁庭对案件事实的正确判断。

(6)仲裁员在仲裁该案时有索贿受贿，徇私舞弊，枉法裁决行为。

二、不予执行仲裁裁决的法定情形有哪些

(一)当事人在合同中没有订有仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁协议的；

(二)裁决的事项不属于仲裁协议的范围或者仲裁机构无权仲裁的；

(三)仲裁庭的组成或者仲裁的程序违反法定程序的；

(四)认定事实的主要证据不足的；

(五)适用法律确有错误的；

(六)仲裁员在仲裁该案时有贪污受贿，徇私舞弊，枉法裁决行为的。