夫妻分居多久是否可以协议离婚要视情况而定。夫妻双方出现感情不和，导致长时间分居时，双方可以在意思表示真实的前提下进行协议离婚，因感情不和分居满两年的；经调解无效，应准予离婚。在此所指的因感情不和分居两年以上，只是法院认定夫妻感情破裂而用来判决离婚的条件之一，也就是说分居两年只是判决离婚的其中之一的理由，而并不是必要的条件。

夫妻协议离婚程序

夫妻双方协议离婚必须要办理离婚登记手续，离婚登记必须是夫妻双方自愿离婚的条件下并携带相关有效证件，去所在地的婚姻登记部门依照行政程序办理的，一般协议离婚的程序是比较简单的，只要夫妻双方自愿离婚，并且对所有的财产和子女分配无异议，签订离婚协议书，经婚姻登记机关审查通过即可离婚。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。