劳动和社会保障部办公厅《劳动和社会保障部办公厅关于对事实劳动关系解除是否应该支付经济补偿金问题的复函》(2001年11月26日)规定，“劳动合同期满后，劳动者仍在原用人单位工作，用人单位未表示异议的，劳动者和原用人单位之间存在的是一种事实上的劳动关系，而不等于双方按照原劳动合同约定的期限续签了一个新的劳动合同。一方提出终止劳动关系的，应认定为终止事实上的劳动关系”。该复函并没有直接回答此种情况下，是否应该支付经济补偿金，只是强调所终止的是事实劳动关系，而非所续签的新的劳动合同。故问题的关键在于用人单位解除事实劳动关系是否需要补偿。

关于这个问题，其实早在1996年劳动部办公厅就有专门的文件对类似问题给出了答复，在《劳动部办公厅关于用人单位不签订劳动合同员工要求经济补偿问题的复函》(1996-09-05劳办发[1996]181号)中明确规定，“用人单位与劳动者之间形成事实劳动关系后，用人单位故意拖延不订立劳动合同并解除与劳动者的劳动关系，劳动者因要求经济补偿与用人单位发生劳动争议后，如果劳动者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，劳动争议仲裁委员会应予受理，并依据《劳动法》第九十八条、《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》(劳部发〔1994〕481号)和《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》(劳部发〔1995〕223号)的有关规定处理”。

故在员工与用人单位因为未续签劳动合同而形成事实劳动关系后，用人单位应当及时补签劳动合同。如果用人单位不补签合同而要求解除事实劳动关系的，则应当适用《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》的规定，向劳动者支付经济补偿金。虽然司法解释明确规定，依法要求解除事实劳动关系的，法院应当支持。但这和要求用人单位支付经济补偿金是不矛盾的。

一、如何解除？

《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释》(自2001年4月30日起施行)第十六条规定：“劳动合同期满后，劳动者仍在原用人单位工作，原用人单位未表示异议的，视为双方同意以原条件继续履行劳动合同。一方提出终止劳动关系的，人民法院应当支持”，而《江苏省江苏省劳动合同条例》(自2003年12月1日起施行)第三十七条第二款规定，“劳动合同期满，用人单位未及时与劳动者办理终止或者续订劳动合同手续，劳动者仍在用人单位工作的，视为当事人同意以原劳动合同约定的除合同期限以外的其他条件继续履行劳动合同。劳动者可以随时终止劳动关系，但用人单位提出终止劳动关系的，应当提前三十日书面通知劳动者”。