在停薪留职期间的员工社保问题需要与公司商议，按用人单位规定执行，如劳动合同上注明，停薪留职单位会继续缴纳社保，那么自然可以按照合同上面的规定来，反之则需要员工自行缴纳。

根据目前的司法实践，一般原则下，如果劳动者在停薪留职期间，未与用人单位就社保缴纳问题做相关明确约定或签订书面协议，劳动者虽在停工留薪期内与用人单位仍然保有劳动关系，但实际上没有给用人单位提供过劳务，也不接受用人单位的日常管理，那么，用人单位一般便无义务为劳动者缴纳该期间的社会保险费，劳动者缴纳社保的诉求，一般也不会得到仲裁机构的支持。因此，劳动者再停薪留职之前，最好就社保缴纳的问题与用人单位达成一致，以免影响相关的社保待遇。

什么情况可以停薪留职

停薪留职合同是指为了使特定职工有期限离岗停薪并保留职工身份，而由用人单位与该职工依法签订的，约定停薪留职期间双方相互权利和义务的合同。该合同产生于20世纪80年代，只适用于原固定职工，不适用劳动合同制职工，那么什么情况可以停薪留职呢？凡是企业不需要的富余职工，可以允许“停薪留职”。对于未经批准而擅自离职的职工，按自动离职处理。企业的固定职工要求“停薪留职”去从事政策上允许的个体经营，对于发挥富余职工的积极性，克服企业人浮于事的现象，有一定好处。一般“停薪留职”的时间一般不超过二年。“停薪留职”期间，不升级，不享受各种津贴、补贴和劳保福利待遇；因病、残而基本丧失劳动能力的，可按退职办法处理；从事非法活动，符合《企业职工奖惩条例》规定的开除条件的，原单位有权按开除处理。