拆迁时不会赔偿拆除的小产权房，因当事人不对该房屋具有所有权，因此拆迁部门不会对其进行赔偿。根据国有土地上房屋征收与补偿条例规定，人民政府应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。

一、拆迁补偿协议合法吗？

不合法。依据国有土地上房屋征收与补偿条例的规定，房屋拆迁补偿协议是由拆迁方与被拆迁方签订才能法律效力的，拆迁公司不是拆迁的主体。国有土地上房屋征收与补偿条例第二十五条房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。第二十六条房屋征收部门与被征收人在征收补偿方案确定的签约期限内达不成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确的，由房屋征收部门报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府依照本条例的规定，按照征收补偿方案作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告。补偿决定应当公平，包括本条例第二十五条、第一款规定的有关补偿协议的事项。被征收人对补偿决定不服的，可以依法申请行政复议，也可以依法提起行政诉讼。

二、西安怎样领取祖遗户补偿

房屋拆迁纠纷一般分为两类，一类是：国有土地上房屋的拆迁，应当依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》规定的法定程序执行。在该法中也规定了政府及职能部门的职责，如果存在违法且侵害他人合法权益，则权益被侵害人可以依法申请行政复议或行政诉讼。对于补偿标准问题，法律规定是不低于周边房屋市场价格。另一类是：集体土地上房屋的拆迁，应当依照《中华人民共和国土地管理法》及各地集体土地上房屋拆迁办法执行，此类拆迁也应依法进行。补偿标准也应当参照国有土地上房屋征收与补偿条例精神执行。

三、知道罚款后拆除有没有补偿吗

依据我国相关法律的规定，违法的建筑物是不受法律保护的，对违法的建筑进行拆迁时，被拆迁人是没有拆迁经济补偿的。《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条，市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。