结婚分居两年并不会自动离婚。我国法律规定的离婚方式有协议离婚和诉讼离婚。协议离婚需要当事人之间协商一致，签订离婚协议书并进行登记；诉讼离婚中，只有在法院审理后确定夫妻感情已经破裂才判决准予离婚，其中，夫妻因感情不和分居满二年是能证明夫妻感情确已破裂的情形之一。

一、有保证书能否离婚

有保证书是可以离婚的。离婚方式有协议离婚和诉讼离婚。协议离婚需要当事人之间协商一致,签订离婚协议书并到婚姻登记机关申请离婚登记;诉讼离婚中,有证据证明夫妻感情确已破裂,调解无效的情形，是可以判决准予离婚的。

二、最新离婚申请流程是什么？

申请离婚的具体程序：协议离婚需要当事人之间协商一致，签订离婚协议书并进行登记，在婚姻登记机关受理登记后的三十日后的三十日内再去申请离婚证；诉讼离婚是一方向法院起诉，提交能证明夫妻感情确已破裂的证据，法院经审理后能确定夫妻感情破裂的，应当判决准予离婚。