建筑企业农民工工资保证金退还手续如下：

1、建筑工程主体完工后，经审核确认建筑施工企业无拖欠农民工工资的行为，退还建筑施工企业60%的工资保证金；

2、设工程全部完工后，经审核确认建筑施工企业无拖欠农民工工资的行为，退还建筑施工企业剩余40%的工资保证金；

3、设单位在建设工程全部完工办理决算后，经确认无拖欠行为，全部退还建设单位所缴纳的工资保证金。

一、民工工资保证金怎么算

(一)工程合同价款在100(不含100万)万元以下的，按工程合同价款的5%预存程合同价款在100万以上至200万元的(含100万元)，按工程合同价款的4%预存程合同价款在200万元至500(含200万)万元的，按工程合同价款的3%预存程合同价款在500万元以上的(含500万)，按工程合同价款的2%预存(二)上年未完工的在建工程，建筑施工企业按剩余施施工量和相应比例补存工资保证金(三)包工不包料的工程按工程合同价款的8%预存。

二、农民工工资保证金概念是哪些什么情况下可支取保证金

农民工工资保证金，是指在工程开工之前，由建设工程项目审批行政部门负责通知，并监督建设单位按照工程合同价款的3%向银行专户存储的工资专项资金。

可支取保证金的情形：经劳动保障部门查证属实后可以支取保证金。