建筑企业农民工工资保证金退还手续如下：1、建筑工程主体完工后，经审核确认建筑施工企业无拖欠农民工工资的行为，退还建筑施工企业60％的工资保证金；2、设工程全部完工后，经审核确认建筑施工企业无拖欠农民工工资的行为，退还建筑施工企业剩余40％的工资保证金；3、设单位在建设工程全部完工办理决算后，经确认无拖欠行为，全部退还建设单位所缴纳的工资保证金。

农民工工资保证金！

农民工工资保证金，是指在工程开工之前，由建设工程项目审批行政部门负责通知，并监督建设单位按照工程合同价款的一定比例向银行专户存储的工资专项资金。保证金根据省、市、县各级项目审批权限实行层级监管，并实行专户存储、专项支取，任何单位和个人不得挪用。

《农民工工资保证金管理暂行办法》第十条建筑施工单位按下列标准预存农民工工资保证金：（一）工程合同价款在100（不含100万）万元以下的，按工程合同价款的5％预存；工程合同价款在100万以上至200万元的（含100万元），按工程合同价款的4％预存；工程合同价款在200万元至500（含200万）万元的，按工程合同价款的3％预存；工程合同价款在500万元以上的（含500万），按工程合同价款的2％预存；

（二）上年未完工的在建工程，建筑施工企业按剩余施施工量和相应比例补存工资保证金；

（三）包工不包料的工程按工程合同价款的8％预存。