1、人民法院指定的清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单时，发现公司财产不足清偿债务的，按以下情形处理：

(1)可以与债权人协商制作有关债务清偿方案。

(2)债务清偿方案经全体债权人确认且不损害其他利害关系人利益的，人民法院可依清算组的申请裁定予以认可。清算组依据该清偿方案清偿债务后，应当向人民法院申请裁定终结清算程序。

(3)债权人对债务清偿方案不予确认或者人民法院不予认可的，清算组应当依法向人民法院申请宣告破产。

2、法律依据：《关于适用若干问题的规定(二)》第十七条

一、为什么要进行公司清算

公司清算的重要性体现在如下几个方面：

第一，公司往往由多人控制，股东众多，而且随着公司经营步入正轨，所有权和经营权发生分离，公司董事、经理开始掌握公司控制权。因此，为了防止实际控制公司的董事、经理或控股股东在公司终止之前私自处分公司财产或不公平地分配公司财产，保护公司股东利益，以法定程序对公司财产进行公平的清算就显得尤为重要。

第二，公司股东对公司承担的是有限责任，以其投资额为限，股东不再对公司债务承担任何责任。公司债务由公司财产进行清偿，因而公司财产是公司债权人利益的保障。在公司终止前依法定的清算程序以公司财产对债权人进行清偿，能够更好地保护债权人的利益和经济秩序的稳定。

第三，公司终止不仅影响股东和债权人的利益，还会影响许多利益相关人的权益，其中最重要的便是公司职工。为了保障公司职工的合法利益，也必须通过法定程序分配公司财产。

综上，清算会影响多方当事人的切身利益，是公司终止的必要步骤。不经清算即终止公司不仅程序不合法，更要承担相应的。