(1)存货盘亏的会计处理《企业会计准则第1号——存货》第二十一条规定：存货盘亏造成的损失，应当计入当期损益。

存货发生的盘亏，应作为待处理财产损溢进行核算。按管理权限报经批准后，根据造成存货盘亏的原因，分别以下情况进行处理：(一)属于计量收发差错和管理不善等原因造成的存货短缺，应先扣除可以收回的保险赔偿和过失人赔偿，将净损失计入管理费用。

(二)属于自然灾害等非常原因造成的存货毁损，应先扣除可以收回的保险赔偿和过失人赔偿，将净损失计入营业外支出。

(2)存货盘亏的税务处理增值税方面：如果因非正常原因导致的存货盘亏，依据《增值税暂行条例》第十条第二款规定，不能抵扣进项税额，会计处理应该做进项税额转出。

企业所得税方面：存货盘亏损失，应该做清单申报或专项申报，不是专项备案。需要提供的备案材料需要依据国家税务总局公告2011年第25号规定提交：第二十六条存货盘亏损失，为其盘亏金额扣除责任人赔偿后的余额，应依据以下证据材料确认：(一)存货计税成本确定依据;(二)企业内部有关责任认定、责任人赔偿说明和内部核批文件;(三)存货盘点表;(四)存货保管人对于盘亏的情况说明。

商业零售存货盘亏应当按照《国家税务总局关于商业零售企业存货损失税前扣除问题的公告》(国家税务总局公告2014年第3号)的规定处理，因零星失窃、报废、废弃、过期、破损、腐败、鼠咬、顾客退换货等正常因素形成的损失，为存货正常损失，准予按会计科目进行归类、汇总，然后再将汇总数据以清单的形式进行企业所得税纳税申报，同时出具损失情况分析报告;因风、火、雷、震等自然灾害，仓储、运输失事，重大案件等非正常因素形成的损失，为存货非正常损失，应当以专项申报形式进行企业所得税纳税申报。但是存货单笔(单项)损失超过500万元的，无论何种因素形成的，均应以专项申报方式进行企业所得税纳税申报。