自动离职合同应该按下列方式进行处理：

1、用人单位需对该劳动合同的文本至少保存二年备查；

2、若是劳动者违法离职，给单位造成损失的，用人单位可以要求劳动者承担赔偿责任。

一、劳动合同终止需要签订协议吗

劳动合同终止的，用人单位与劳动者不需要签订协议，只需要用人单位提供解除劳动证明即可。解除劳动合同后，用人单位应在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。

二、旷工辞退是否有工资

旷工辞职有工资。

劳动者旷工离职属于严重违反了公司的规章制度，公司有权和劳动者解除劳动合同，结束劳动关系。虽然没有补偿和赔偿，但是劳动者的工资还是需要正常支付的。如果公司不给劳动者发送工资，那么劳动者可以向仲裁机构提起劳动仲裁，维护自己的合法权利。

员工无违法违规行为，员工与公司协商一致办理离职手续的，公司应该全额支付工资。员工按照公司的规定自动办理离职手续，若是给用人单位造成损失的，用人单位可基于法律规定要求劳动者赔偿损失。用人单位在确认员工未按规定履行请假手续而擅自离岗，且无正当理由的，用人单位基于劳动者这一事实行为作出解除劳动合同的决定。

三、原单位的劳动合同丢失了怎么办

如果劳动者丢失了原用人单位的劳动合同，可以到该单位复印其保存的劳动合同，标注复印来源即可。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。劳动合同经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效，由用人单位和劳动者各执一份。