夫妻分居多年的可以通过协议离婚和诉讼离婚的方式办理离婚。夫妻双方离婚的可以先协商处理，如果对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，可以办理协议离婚；如果协商不成，可以到法院起诉，由法院进行判决。对于双方因感情不和分居满两年，经法院调解无效的，应当准予离婚。诉讼离婚的前提是双方感情已破裂，如果双方仍有感情，则不利于法院判决离婚。

怎样才能证明夫妻分居

可以证明夫妻分居的常见证据：

1、一方居住在外的房屋租赁合同；

2、双方签订的书面分居协议必须书面，口头协议必须由对方承认；

3、一方向另一方发出的书面分居文件最好邮寄在备注栏中注明分居，并保留邮寄凭证。从邮寄之日起至离婚期间，属于夫妻分居时间；

4、双方的信件和电子邮件可以证明双方的感情不和。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。