毫无疑问，施工合同与施工合同补充协议时两个不同的概念，可以说，一个时主合同，一个时从合同，补充协议可以说时是没有独立性的。施工合同是原始的双方签订的施工协议，补充协议是在施工合同基础上进行的修改和补充。

一、招标公司施工合同补充协议是否有效

施工合同补充协议依法成立即有效。合同补充协议作为合同的一部分，与合同具有同等法律效力。合同作为一种民事法律行为，是当事人协商一致的产物，是两个以上的意思表示相一致的协议。只有当事人所作出的意思表示合法，合同才具有法律约束力。

二、补充协议与合同的区别

已经存在的合同与补充协议之间是主从关系。已经存在的合同是主合同，补充协议是从合同。补充协议的内容应当是主合同的非主要内容，也可以说是非主要条款。如果是主合同的主要条款没有约定或者约定不明确，主合同不成立也不生效。

三、建筑施工合同主要内容有哪些

建设工程合同根据是勘察、设计合同和施工合同的不同，其内容也不同。《民法典》第七百九十四条【勘察、设计合同的内容】勘察、设计合同的内容一般包括提交有关基础资料和概预算等文件的期限、质量要求、费用以及其他协作条件等条款。第七百九十五条【施工合同的内容】施工合同的内容一般包括工程范围、建设工期、中间交工工程的开工和竣工时间、工程质量、工程造价、技术资料交付时间、材料和设备供应责任、拨款和结算、竣工验收、质量保修范围和质量保证期、相互协作等条款。