不会，婚姻关系不会自动解除，因感情不和分居满两年，可以向法院起诉离婚。证据充分的话，法院会判决离婚不管分居多久，婚姻关系都不会自动离婚的。夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

一、分居离婚要去哪申请

分居离婚要去民政局或法院。离婚可以选择协议离婚或诉讼离婚。男女双方自愿离婚的，必须向婚姻登记机关申请离婚登记。夫妻双方不能就离婚、离婚后子女抚养或财产分割达成协议，一方可以向人民法院提起诉讼。人民法院依照诉讼程序审理后，将调解或判决解除婚姻关系。无论分居多久，如果双方都不提出离婚，婚姻都不会自动解除。如果起诉法院离婚，法院将支持离婚，因为感情不和分居两年。

二、民法协议离婚后出现婚姻关系终止是否合法

离婚协议不会导致婚姻关系的终止，夫妻双方自愿签订离婚协议后还需亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内没有一方撤回离婚申请的，期满后双方亲自到婚姻登记机关申请离婚证，发予离婚证的婚姻关系终止。《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条：夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。《中华人民共和国民法典》第一千零七十七条：自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。

三、解除婚姻关系的情形有哪些

解除婚姻关系的情形有以下六种：

1、重婚或者与他人同居；

2、实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

3、有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

4、因感情不和分居满二年；

5、其他导致夫妻感情破裂的情形；

6、一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

根据相关规定，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。