不可以，年终奖属于劳动报酬的范围，只要员工符合公司规章制度规定发放年终奖的条件，公司就应当发放年终奖。公司提出协商解除劳动合同的要支付经济补偿金，经济补偿金不能用年终奖抵扣。如果公司没有合法理由单方解除劳动合同，员工可以要求支付赔偿金。公司的做法不合法，有劳动争议的可以去劳动局投诉或者去劳动仲裁委申请劳动仲裁。

企业的规章制度不能与现行法规相违背。年终奖一般是单位对在职职工干一年工作的奖励，由企业自主掌握。

经济补偿金是指劳动合同解除时，企业依据劳动法规的相关规定，给职工一定数额的经济补偿。职工如果未解除劳动合同，就不存在领取经济补偿金这一说法。

经济补偿金分段计算：在劳动合同法施行前签订，试行后解除的劳动合同，依照劳动合同法规定应当支付经济补偿的，经济补偿年限自2008年1月1日起计算，劳动合同法施行前按照当时有关规定执行。经济补偿金计算年限：对于因用人单位的合并、兼并、合资、单位改变性质、法人改变名称等原因而改变工作单位的，其改制前的工作时间可以计算为“在本单位的工作时间。另外，劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作的，劳动者在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位的工作年限。原用人单位已经向劳动者支付经济补偿的，新用人单位在依法解除、终止劳动合同计算支付经济补偿的工作年限时，不再计算劳动者在原用人单位的工作年限。经济补偿金计算基数：经济补偿金中的月平均工资是指劳动者在解除劳动合同前12个月的月实际平均工资，而不仅仅是劳动合同中约定的基本工资。根据劳动部《关于贯彻执行

中华人民共和国劳动法若干问题的意见》的规定，“工资”是指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬，一般包括计时工资、计件工资、资金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。

年终奖一般都是公司自治的，并不是法律强制性规定的，但是经济补偿金是法律强制性规定的，所以二者是不可以代替的。经济补偿金是因为用人单位没有正当理由将员工辞退，存在过错，应当给予受损害员工补偿。

一、计算协商解除劳动合同的补偿的工作年限

劳动者在单位工作的年限，应从劳动者向该用人单位提供劳动之日起计算。如果由于各种原因，用人单位与劳动者未及时签订劳动合同的，不影响工作年限的计算。

（一）如果劳动者连续为同一用人单位提供劳动，但先后签订了几份劳动合同的，工作年限应从劳动者提供劳动之日起连续计算；

（二）随着劳动合同法的实施，用人单位利用短期劳动合同长期用工的现象将会减少，这主要是劳动合同法规定了两个措施：

1、连续签订两次固定期限劳动合同的，劳动者可以要求签订无固定期限劳动合同；

2、劳动合同期满终止的，用人单位也要依法支付经济补偿。

（三）我们可以根据劳动部1996年《关于终止或解除劳动合同计发经济补偿金有关问题的请示的复函》的规定，对于因用人单位的合并、兼并、合资、单位改变性质、法人改变名称等原因而改变工作单位的，其改制前的工作时间可以计算为在本单位的工作时间；

（四）根据《劳动合同法》第九十六条第三款的规定，在《劳动合同法》施行前签订，施行前解除或者终止的劳动合同，依照劳动法和原有关国家规定计算解除劳动合同的补偿的经济补偿；

（五）在《劳动合同法》施行前签订，施行后解除或者终止的劳动合同，依照《劳动合同法》第四十六条规定应当支付解除劳动合同的补偿的经济补偿的，解除劳动合同的补偿的经济补偿年限自本法施行之日起计算；

（六）《劳动合同法》施行前按照当时有关规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿的，按照当时有关规定执行。